Ikhtisar
Buku ini akan memberikan informasi untuk mendukung materi untuk matakuliah Fisiologi Mikroba di Prodi S1 Biolgi Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Riau. Buku ini memaparkan tentang struktur eksternal dan internal sel prokaryot, pertumbuhan dan perkembangan, metabolisme prokaryot dalam memanfaatkan glukosa dan biopolimer lainnya. Selain itu, buku ini juga dilengkapi dengan contoh-contoh bagaimana bakteri endogenous Riau dapat memeta-bolisme berbagai substrat sehingga dapat diaplikasikan untuk lingkungan dan industri. Buku ini disusun berdasarkan beberapa bahan rujukan dan hasil beberapa penelitian sebelumnya dan Penelitian Dasar Kompetisi Nasional (PDKN) pada tahun 2022.
Pendahuluan / Prolog
Pendahuluan
Sebelum mempelajari Fisiologi Mikroba kita dapat memahami perkembangan dan perannya mikroba di dalam menghasilkan banyak produk. Pada pertemuan pertama kita akan mengingatkan kembali pengetahuan dasar tentang apa itu mikroba dan perannya bagi keberlangsungan kehidupan.Setelah mempelajari bab ini diharapkan mahasiswa dapat: komponen penyususn sel mikroba serta metabolisme yang dihasilkannya.
Sel bakteri dari suatu kultur murni yang ditumbuhkan melalui teknik sentrifuse dan penyaringan kedalam medium cair. Suatu kultur bakteri menghasilkan masa bakteri seberat 100 mg, masa ini dapat dianalisis dengan beberapa metoda untuk mengetahui komposisi kimianya. Sebagian dapat dikeringkan untuk menentukan kandungan airnya, dan setelah kering dapat dipakai untuk menentukan komposisi unsur-unsurnya. Hasil yang diperoleh, 70% dari masa sel adalah air, kurang dari 90% kandungan air yang biasa kita dapatkan dalam sel organisme tingkat tinggi (tanaman atau hewan).
Analisis unsur-unsur masa sel seperti Escherichia coli komposisi protoplasma yang kandungannya terdiri dari: 50% karbon, 20% oksigen, 14% nitrogen, 8% rganic, 3% fosfor, 2% kalium, 1% belerang, masing-masing 0.05% untuk kalium, magnesium dan klor, 0.2% besi dan 0.3% unsur-unsur mikronutrien (trace elements) yang meliputi Mn, Co, Cu, Zn, dan Mo. Diduga, sebagian besar masa bakteri terdiri dari senyawa-senyawa organik. Hasil analisis secara menyeluruh bakteri memiliki: molekul makro yang sebagian besar (96%) dari masa kering sel bakteri; protein yang jumlahnya lebih2 dari separuh masa kering bakteri; kandungan RNA yang lebih besar pada sel bakteri berbanding kandungan RNA dalam sel organisme tingkat tinggi. Bakteri memilik dua senyawa utama yang unik yaitu murein dan liposakarida. Ribosom pada prokaryot itu adalah 70 S yang tersusun atas sub unit kecil 30S dan sub unit besar 30S. Ribosom disusun atas 60% RNA dan 40% protein. Ribosomal berfungsi sebagai tempat sintesis protein di dalam sitoplasma.
Daftar Isi
Sampul Depan
Prakata
Daftar Isi
Daftar Gambar
Daftar Tabel
Bab 1. Pendahuluan
Tujuan Pembelajaran
Ringkasan
Soal Latihan
Bab 2. Struktur Sel Prokariot Dan Peranannya
Tujuan Pembelajaran
2.1. Eksternal Sel Prokariot
1. Flagella
2. Axial Filaments
3. Glikokalik
4. Dinding sel
2.2. Internal Se
1. Membran
2. Sitoplasma
3. Ribosom
4. Materi genetik, dan plasmid, untuk beberapa bakteri
5. Nukleoid
6. Endospora
Ringkasan
Soal Latihan
Bab 3. Pertumbuhan Mikroorganisme
3.1. Pertumbuhan
3.2. Kurva Pertumbuhan
3.3. Pengukuran Pertumbuhan Mikroba
3.4. Kultur Kontinyu Mikroorganisme
3.5. Pengaruh Faktor Lingkungan terhadap Petumbuhan
3.6. Pertumbuhan Mikroorganisme Dalam Lingkungan
Ringkasan
Soal Latihan
Bab 4. Metabolisme Karbohidrat: Glukosa
Tujuan Pembelajaran
1.1. Embden Mayerhof Pathway (EMP Pathway)
1.2. Sintesis Glukosa-6-Fosfat: Glukoneogenesis
1.3. Jalur Heksosa Monofosfat (HMP)
1.4. Jalur Entner – Doudorof (ED)
1.5. Jalur Fosfoketolase
Ringkasan
Latihan Soal
Bab 5. Asam Trikarboksilasi Dan Turunannya
Tujuan Pembelajaran
5.1. Dekarboksilase oksidatif piruvat
5.2. Jalur Asam Trikarboksilasi dan asam sitrat
5.3. Regulasi siklus TCA
5.4. Pengisian zat antara siklus TCA
5.5. Fosforilasi Oksidati
Ringkasan
Latihan
Bab 6. Metabolisme Polimer Dan Aplikasi
Tujuan Pembelajaran
6.1. Hidrolisis Polimer
6.2. Hidrolisis polisakarida Lain
6.3. Fosforilasi Disakarida
6.4. Hidrolisis Protein, Nukleat dan Lipid
Ringkasan
Latihan Soal
Bab 7. Tujuan Pembelajaran
Tujuan Pembelajaran
7.1. Oksidasi Hidrokarbon alifatik
7.2. Oksidasi senyawa aromatik
Ringkasan
Latihan
Bab 8. Transpor Membran: Penyerapan Nutrisi Dan Ekskresi Protein
Tujuan Pembelajaran
8.1. Ionopor: Model Protein Pembawa
8.2. Difusi: Transfor Pasif
8.3. Transfor Aktif
8.4. Gerakan dan Taksis (Motility and Taxes)
Ringkasan
Latihan
Glosarium
Referensi
Sampul Belakang